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后期管理控制温度在22—28 空气相对湿度在90%—95%，每天浇水一次，做到湿而不见水，忌长时期积水，同时做好通风管理，灵芝原基生长迅速，日生长速度可达0.5-1cm，边缘向外扩展，形成菌盖，菌盖边缘乳白色，菌盖一圈圈向外扩散生长。采收经过20d左右，灵芝菌盖边缘乳白色-乳黄色圈消失，菌盖开始革质化，呈棕色，表明菌盖已停止生长，但还可进行加厚生长。菌盖下面子实层内弹射出棕红色担孢子时，表明子实体已成熟，即可采收。采收时用锋利的小刀或果技剪在菌柄0.5-1cm处割取。采收后的子实体应及时晒干或烘干，然后装袋入库储藏。
免疫调节作用灵芝抱子在传统中药中用来调节免疫系统已有较长历史.Pan等閔观察灵芝抱子多糖对甲基硝基亚硝基胍（MNNG）诱发胃癌大鼠的免疫性和抗氧化活性的影响发现，给予患胃癌大鼠灵芝抱子多糖后，可以降低血清和胃组织中脂质过氧化产物水平，并使胃癌所致的血清SOD、CAT和GSH-Px水平趋于正常，表明灵芝抱子多糖具有一定的免疫调节作用和抗氧化作用.实验发现，灵芝抱子可以提高ConA诱导的小鼠淋巴细胞转化能力，增强SR-BC诱导的小鼠足肿胀，增加溶血空班数等，表明灵芝抱子主要通过作用于免疫细胞增强其活性，从而直接或间接调节机体免疫功能.抗氧化作用灵芝的抗氧化作用与多糖有关，并与多糖的单糖组成、分子量有较大关系.Heleno等28在对灵芝不同部位多糖的提取中发现，灵芝菌丝体中提取的多糖含量高，灵芝抱子中提取的多糖抗氧化活性好，其DPPH率为0.15mg/mL,还原能力为0.69mg/mL，均比其他部位提取的多糖抗氧化能力强.Deepalakshmi 实验发现灵芝抱子的乙醇提取物表现出强烈的抗氧化活性，其体外抗氧化活性显示，灵芝抱子的乙醇提取物对ABST、DPPH、OH-、O2－的体外能力均较抗坏血酸低，但相差不大.
出芝管理前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要为水分、通气、温度光照三要素的调节，要保持适宜的温度、湿度、光照和控制通风量，温度要保持在22—26T，空气相对湿度要保持在85%—90%，初期以保温为主，白天拉开一层遮阳网，接受光照，避免日光直射，增加土壤温度，中午气温过高时，应开窗通风，喷水降温。在汉中约15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）气温上升，温差较大，白天注意降温，控制温度在22—28空气相对湿度要保持在90%—95%;晚间应放下薄膜减少温差。光照采用双层遮阳网控制，制造出闪烁型林下散射光。此阶段，菌原基生长较快，每2—3d要进行通风换气，灵芝对二氧化碳非常敏感，否则，会造成灵芝菌柄长、不开伞或畸形。在此期间要定苗修头，原基生长20d后海袋选留1株强势菌株，并对其上生长点进行修头，即修成马蹄形，利于商品外形一致，提高灵芝菌盖的商品率，一般次修完后10d，应再进行一次留株修头。
第3个是六芝和灵芝之间的联系，在中国古代“灵芝”一词有很多含义，而《神农本草经》中的六芝只是根据药性进行系统的分类。人们将灵芝当作祥瑞，大概认为它有“灵”，主要是由药性和丰富的象征意象共同决定。一些专家学者将六芝与灵芝进行对比分析得出结论：六芝从根本上说，它的组成只是由赤芝和紫芝。《神农本草经》中记载的黄芝、白芝、青芝、黑芝四芝，在其他古代药物著作中，对它们的记载很少，对它们的记载，第1个是《本草纲目》，书中是这样描述的：黑芝又非常撤且多黄白，稀有黑青者；第2个是《瑞应图》，书中是这样描述的：芝草常以六月生，春青、夏紫、秋白、冬黑。根据现代的药物研究者研究和查找相关药物著作得出：赤芝在成长阶段，初的菌盖是白色或者是黄白色，紫芝的菌盖颜色比较深，接近于黑色。古代医学著作中所记载的黄芝、白芝、青芝、黑芝四芝也可能指的就是赤芝及紫芝。一些药物学家认为，灵芝的主要特征是菌盖的外形像人的肾脏，半圆形或者类似于圆形，表面颜色呈褐黄色或红梅色，有很好的光泽性，还具有菌柄。菌肉的上半部分的颜色较浅，下半部分较深，与许多医学著作所记载赤芝很相似，因此赤芝这一类灵芝可以作为灵芝的代表的说法是很有权威性的，推测古代医学著作中的灵芝就是赤芝。
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