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防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。选用优良品种，对退化品种进行提纯复壮选用抗病性强、生活力强、高纯度的菌种进行接种。经多年试验示范，以采收子实体为主的菌株“日本赤灵芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黄山8号”两个优良菌株较适宜我省气候特点及段木熟料灵芝栽培模式，由于栽培多年，该两个品种有退化趋势，需进行提纯复壮。科学安排栽培季节根据中原地区气候特点，短段木灵芝菌棒制作期选在11月上旬至翌年2月上旬为宜，在此时段内，为让菌丝有足够的发菌时间，宜利用当地气候资源，提早制作菌棒。
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“灵芝草”的涵义古代的百姓用“芝草”“瑞草”“仙草”“还阳草”等词汇来形容灵芝，从这个现象来看，古代百姓认为“灵芝”的概念与“草”具有十分密切的联系。大概是因为古代主要的认知方法是观察法的原因，将灵芝看成是草，可能是灵芝科的真菌生长特别缓慢，当其实体生长在杂草较多的地方，因为菌盖下方的草需要穿过菌盖进行光合作用，造成灵芝和杂草成为一个整体的现象，从而被古人描述成“草从芝出”。再一个，从含义来看“芝”“灵芝”“芝草”等字词涵义具有多样化，它所涵盖的不只是灵芝，还有一些非真菌类的生物。因此，在分辨是否是灵芝，需要有充足的证据去证明。灵芝的象征在古代人民的价值观里，出现灵芝，是上天和人相互感应的结果。出现灵芝后，古代的统治者认为这是上天对自己管理天下的一种肯定，唐代的一些著作写到：“仪凤间，河西蝗，独不至方翼境，而它郡民或馁死，皆重茧走方翼治下；乃出私钱作水硝簿其赢，以饥嚓，构舍数十百楹居之，全活甚众，芝产其地”在宋代的书籍中是这样描述的：“芝草，慈仁则生”又云：“芝英者，亲近眷老、养有道则生”然而有些人利用这种现象来达到自己的目的。
酶解法．酶解法通过利用几丁质酶、纤维素酶或溶壁酶等酶液的一种或多种，使灵芝抱子细胞壁中的成分降解，释放其有效成分．使用生物酶辅助提取灵芝酸A，终实现灵芝酸A的提取率达到0.54%． 溶菌法．利用微生物和灵芝抱子一同发酵，让微生物在发酵过程中降解灵芝抱子细胞壁．利用益生菌枯草芽抱杆菌、嗜酸乳杆菌与灵芝抱子进行液态发酵，终使得灵芝抱子破壁率达到85%以上．化学法化学法的优点与生物法较为相似;缺点是提取溶剂易导致有效成分变性，且溶剂残留不易去除．溶剂提取法．溶剂提取法利用“相似相溶”原理，使灵芝抱子在水、乙醇等溶剂中长时间浸泡或回流，从而使有效成分扩散到溶剂中.例如,Lee等8采用25%乙醇提取灵芝中的成分，终减压浓缩并定容至500mL保存，通过灵芝的25%乙醇提取物，研究其通过Nrf2/HO-1通路增强细胞的抗氧化作用，该方法对灵芝孢子的提取率较好．
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